Um grupo de agentes especiais, que actuam fora da cadeia militar de comando, deve investigar qualquer delito com provas relacionadas com a marinha e o pessoal do corpo de marines norte-americano, qualquer que seja o cargo ou posição hierárquica. À frente da equipa Navy CIS (Serviço de Investigação Criminal da Marinha) está o agente especial Leroy Jethro Gibbs (Mark Harmon - Os Homens do Presidente, Chicago Hope), um especialista na área da investigação que não hesitará em quebrar algumas regras para executar bem o seu trabalho.
